Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnnm2Q3TWN3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnnm2Q3TWN3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnnm2Q3TWN3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms