Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calr4Q3TQS0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms