Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrx1Q3TL44 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrx1Q3TL44 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms