Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp4cQ3TKR3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp4cQ3TKR3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms