Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Riiad1Q3KNY5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riiad1Q3KNY5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riiad1Q3KNY5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms