Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b3Q0VF55 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms