Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc7a1Q09143 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc7a1Q09143 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms