Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q08AU9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q08AU9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q08AU9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q08AU9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q08AU9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q08AU9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q08AU9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q08AU9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q08AU9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q08AU9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q08AU9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q08AU9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q08AU9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q08AU9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q08AU9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q08AU9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q08AU9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q08AU9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q08AU9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q08AU9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q08AU9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q08AU9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q08AU9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q08AU9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q08AU9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q08AU9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q08AU9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q08AU9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Q08AU9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q08AU9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q08AU9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q08AU9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q08AU9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q08AU9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q08AU9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q08AU9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q08AU9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q08AU9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q08AU9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q08AU9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q08AU9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q08AU9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q08AU9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q08AU9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q08AU9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q08AU9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q08AU9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q08AU9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q08AU9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q08AU9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q08AU9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q08AU9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q08AU9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q08AU9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q08AU9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q08AU9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q08AU9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q08AU9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q08AU9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q08AU9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q08AU9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q08AU9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q08AU9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q08AU9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q08AU9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q08AU9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q08AU9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q08AU9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q08AU9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q08AU9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q08AU9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q08AU9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q08AU9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q08AU9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q08AU9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q08AU9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q08AU9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q08AU9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q08AU9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q08AU9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q08AU9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q08AU9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q08AU9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q08AU9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q08AU9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q08AU9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q08AU9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q08AU9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q08AU9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q08AU9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q08AU9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q08AU9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q08AU9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q08AU9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q08AU9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q08AU9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q08AU9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q08AU9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q08AU9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.9 ms