Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tgm3Q08189 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tgm3Q08189 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms