Protein–RNA interactions for Protein: Q05CL8

Larp7, La-related protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp7Q05CL8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Larp7Q05CL8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Larp7Q05CL8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms