Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms