Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl7Q03366 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl7Q03366 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms