Protein–RNA interactions for Protein: Q03141

Mark3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark3Q03141 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mark3Q03141 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mark3Q03141 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mark3Q03141 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms