Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Mc1rQ01727 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mc1rQ01727 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms