Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Il6stQ00560 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms