Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax8Q00288 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax8Q00288 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms