Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cry1P97784 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cry1P97784 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cry1P97784 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cry1P97784 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cry1P97784 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cry1P97784 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cry1P97784 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cry1P97784 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cry1P97784 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cry1P97784 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cry1P97784 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cry1P97784 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cry1P97784 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cry1P97784 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cry1P97784 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cry1P97784 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cry1P97784 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms