Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarcc1P97496 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms