Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SmsP97355 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SmsP97355 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SmsP97355 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SmsP97355 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SmsP97355 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SmsP97355 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SmsP97355 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SmsP97355 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SmsP97355 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SmsP97355 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SmsP97355 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SmsP97355 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SmsP97355 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SmsP97355 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SmsP97355 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SmsP97355 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SmsP97355 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SmsP97355 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SmsP97355 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SmsP97355 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SmsP97355 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SmsP97355 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SmsP97355 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SmsP97355 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SmsP97355 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SmsP97355 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SmsP97355 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SmsP97355 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SmsP97355 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SmsP97355 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SmsP97355 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SmsP97355 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SmsP97355 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SmsP97355 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SmsP97355 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SmsP97355 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SmsP97355 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SmsP97355 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SmsP97355 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SmsP97355 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SmsP97355 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SmsP97355 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SmsP97355 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SmsP97355 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SmsP97355 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SmsP97355 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SmsP97355 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SmsP97355 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SmsP97355 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SmsP97355 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SmsP97355 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SmsP97355 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SmsP97355 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SmsP97355 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SmsP97355 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SmsP97355 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SmsP97355 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SmsP97355 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SmsP97355 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SmsP97355 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SmsP97355 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SmsP97355 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SmsP97355 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SmsP97355 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SmsP97355 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SmsP97355 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SmsP97355 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SmsP97355 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SmsP97355 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SmsP97355 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SmsP97355 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SmsP97355 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SmsP97355 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SmsP97355 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SmsP97355 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SmsP97355 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SmsP97355 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SmsP97355 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SmsP97355 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SmsP97355 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SmsP97355 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SmsP97355 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SmsP97355 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SmsP97355 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SmsP97355 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SmsP97355 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SmsP97355 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SmsP97355 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SmsP97355 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SmsP97355 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SmsP97355 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SmsP97355 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SmsP97355 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SmsP97355 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SmsP97355 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SmsP97355 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SmsP97355 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SmsP97355 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SmsP97355 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.8 ms