Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx1P80205 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx1P80205 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx1P80205 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx1P80205 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx1P80205 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx1P80205 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms