Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp7P70280 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms