Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2bP62915 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2bP62915 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms