Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsnl1P62761 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms