Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snrpd1P62315 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpd1P62315 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpd1P62315 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpd1P62315 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpd1P62315 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpd1P62315 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpd1P62315 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpd1P62315 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snrpd1P62315 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snrpd1P62315 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snrpd1P62315 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snrpd1P62315 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snrpd1P62315 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snrpd1P62315 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snrpd1P62315 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snrpd1P62315 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snrpd1P62315 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snrpd1P62315 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snrpd1P62315 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snrpd1P62315 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snrpd1P62315 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snrpd1P62315 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snrpd1P62315 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snrpd1P62315 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snrpd1P62315 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snrpd1P62315 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snrpd1P62315 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snrpd1P62315 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snrpd1P62315 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snrpd1P62315 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snrpd1P62315 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snrpd1P62315 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snrpd1P62315 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms