Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga11P61622 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga11P61622 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga11P61622 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga11P61622 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itga11P61622 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga11P61622 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga11P61622 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga11P61622 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga11P61622 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga11P61622 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms