Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims4P60191 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims4P60191 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims4P60191 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims4P60191 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rims4P60191 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rims4P60191 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rims4P60191 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rims4P60191 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rims4P60191 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rims4P60191 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rims4P60191 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms