Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcif1P59114 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcif1P59114 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms