Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Setd4P58467 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd4P58467 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd4P58467 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd4P58467 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Setd4P58467 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd4P58467 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Setd4P58467 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd4P58467 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms