Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dpf3P58269 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Dpf3P58269 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms