Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdcd5P56812 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms