Protein–RNA interactions for Protein: P56450

Mc4r, Melanocortin receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc4rP56450 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mc4rP56450 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc4rP56450 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms