Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtskP55097 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtskP55097 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtskP55097 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtskP55097 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtskP55097 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtskP55097 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtskP55097 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtskP55097 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtskP55097 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtskP55097 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtskP55097 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtskP55097 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtskP55097 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CtskP55097 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtskP55097 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtskP55097 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtskP55097 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtskP55097 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtskP55097 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtskP55097 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtskP55097 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtskP55097 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtskP55097 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtskP55097 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtskP55097 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtskP55097 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtskP55097 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtskP55097 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtskP55097 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtskP55097 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtskP55097 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CtskP55097 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CtskP55097 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtskP55097 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtskP55097 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtskP55097 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtskP55097 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtskP55097 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtskP55097 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtskP55097 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtskP55097 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtskP55097 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtskP55097 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtskP55097 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtskP55097 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtskP55097 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtskP55097 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CtskP55097 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtskP55097 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtskP55097 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CtskP55097 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtskP55097 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtskP55097 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtskP55097 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtskP55097 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtskP55097 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtskP55097 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtskP55097 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtskP55097 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtskP55097 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtskP55097 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtskP55097 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CtskP55097 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtskP55097 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtskP55097 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtskP55097 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtskP55097 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtskP55097 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtskP55097 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtskP55097 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtskP55097 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtskP55097 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtskP55097 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtskP55097 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtskP55097 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtskP55097 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CtskP55097 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtskP55097 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtskP55097 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtskP55097 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtskP55097 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtskP55097 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtskP55097 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtskP55097 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtskP55097 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtskP55097 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtskP55097 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtskP55097 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CtskP55097 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtskP55097 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtskP55097 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtskP55097 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtskP55097 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtskP55097 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtskP55097 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CtskP55097 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtskP55097 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtskP55097 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtskP55097 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms