Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb3P54285 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms