Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cux1P53564 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux1P53564 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux1P53564 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux1P53564 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux1P53564 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cux1P53564 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cux1P53564 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Cux1P53564 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cux1P53564 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cux1P53564 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cux1P53564 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Cux1P53564 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Cux1P53564 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cux1P53564 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cux1P53564 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cux1P53564 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cux1P53564 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cux1P53564 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cux1P53564 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cux1P53564 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cux1P53564 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Cux1P53564 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cux1P53564 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cux1P53564 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cux1P53564 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cux1P53564 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cux1P53564 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms