Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LtbrP50284 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LtbrP50284 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LtbrP50284 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LtbrP50284 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LtbrP50284 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LtbrP50284 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LtbrP50284 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LtbrP50284 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LtbrP50284 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LtbrP50284 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms