Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdkn1cP49919 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn1cP49919 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms