Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc3P49135 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc3P49135 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms