Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnni3P48787 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnni3P48787 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnni3P48787 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnni3P48787 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnni3P48787 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3P48787 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3P48787 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3P48787 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3P48787 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3P48787 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3P48787 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3P48787 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3P48787 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3P48787 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3P48787 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3P48787 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3P48787 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3P48787 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3P48787 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3P48787 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3P48787 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3P48787 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3P48787 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3P48787 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3P48787 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3P48787 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3P48787 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3P48787 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3P48787 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3P48787 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni3P48787 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni3P48787 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni3P48787 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni3P48787 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni3P48787 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni3P48787 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni3P48787 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni3P48787 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3P48787 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3P48787 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3P48787 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3P48787 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3P48787 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3P48787 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3P48787 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3P48787 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3P48787 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3P48787 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3P48787 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3P48787 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3P48787 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3P48787 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3P48787 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3P48787 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3P48787 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3P48787 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3P48787 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3P48787 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3P48787 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3P48787 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3P48787 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3P48787 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3P48787 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3P48787 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3P48787 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3P48787 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3P48787 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3P48787 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3P48787 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3P48787 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms