Protein–RNA interactions for Protein: P48428

Tbca, Tubulin-specific chaperone A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcaP48428 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbcaP48428 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcaP48428 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcaP48428 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TbcaP48428 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcaP48428 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcaP48428 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TbcaP48428 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 328.2 ms