Protein–RNA interactions for Protein: P47880

Igfbp6, Insulin-like growth factor-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp6P47880 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Igfbp6P47880 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Igfbp6P47880 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Igfbp6P47880 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Igfbp6P47880 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Igfbp6P47880 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Igfbp6P47880 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Igfbp6P47880 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Igfbp6P47880 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Igfbp6P47880 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms