Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax9P47242 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax9P47242 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax9P47242 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax9P47242 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax9P47242 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax9P47242 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax9P47242 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax9P47242 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax9P47242 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax9P47242 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax9P47242 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax9P47242 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax9P47242 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax9P47242 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms