Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf4P43488 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms