Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pola1P33609 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pola1P33609 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pola1P33609 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pola1P33609 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pola1P33609 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pola1P33609 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pola1P33609 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pola1P33609 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pola1P33609 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pola1P33609 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pola1P33609 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms