Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc11P31313 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc11P31313 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc11P31313 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc11P31313 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms