Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd28P31041 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd28P31041 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms