Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NapbP28663 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NapbP28663 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NapbP28663 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NapbP28663 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NapbP28663 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NapbP28663 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NapbP28663 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NapbP28663 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NapbP28663 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NapbP28663 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NapbP28663 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NapbP28663 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NapbP28663 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NapbP28663 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NapbP28663 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NapbP28663 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NapbP28663 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NapbP28663 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NapbP28663 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NapbP28663 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NapbP28663 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NapbP28663 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NapbP28663 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NapbP28663 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NapbP28663 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NapbP28663 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NapbP28663 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NapbP28663 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NapbP28663 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NapbP28663 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NapbP28663 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NapbP28663 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NapbP28663 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NapbP28663 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NapbP28663 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NapbP28663 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NapbP28663 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NapbP28663 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NapbP28663 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NapbP28663 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NapbP28663 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NapbP28663 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NapbP28663 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NapbP28663 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NapbP28663 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NapbP28663 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NapbP28663 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NapbP28663 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NapbP28663 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NapbP28663 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NapbP28663 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NapbP28663 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NapbP28663 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NapbP28663 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NapbP28663 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NapbP28663 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NapbP28663 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NapbP28663 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NapbP28663 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NapbP28663 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NapbP28663 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NapbP28663 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NapbP28663 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NapbP28663 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NapbP28663 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NapbP28663 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NapbP28663 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NapbP28663 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NapbP28663 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NapbP28663 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NapbP28663 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NapbP28663 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NapbP28663 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NapbP28663 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NapbP28663 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NapbP28663 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NapbP28663 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NapbP28663 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NapbP28663 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NapbP28663 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NapbP28663 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NapbP28663 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NapbP28663 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NapbP28663 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NapbP28663 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NapbP28663 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NapbP28663 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NapbP28663 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NapbP28663 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NapbP28663 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NapbP28663 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NapbP28663 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NapbP28663 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NapbP28663 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NapbP28663 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NapbP28663 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NapbP28663 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NapbP28663 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NapbP28663 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms