Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apex1P28352 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apex1P28352 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apex1P28352 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apex1P28352 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apex1P28352 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apex1P28352 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apex1P28352 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms