Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aco1P28271 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aco1P28271 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aco1P28271 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aco1P28271 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aco1P28271 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aco1P28271 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aco1P28271 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aco1P28271 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Aco1P28271 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms