Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpl3P27659 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl3P27659 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms