Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf1bP25119 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf1bP25119 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf1bP25119 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf1bP25119 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms